Projektmanagement im Softwarebereich - OpenMS 2012
Das ist die vorläufige Wiki-Seite zum Praktikum
Projektmanagement im Softwarebereich - OpenMS.
Projektgruppen
- Gruppe 1: Katharina, Oliver, Janett
- Gruppe 2: Alexander, Clemens
Zeitplan
30.03.2012, 14 Uhr |
Vorbesprechung (Ort: A3, SR 119) |
10.04.-13.04.2011 |
OpenMS-Tutorial |
24.04.2012 |
Vorstellung der Projektpläne (Ort: T9, 005, 14:00 Uhr) |
25.05.2012 |
Abgabe des Abschlussberichts |
29.05.2012 |
Vorstellung der Ergebnisse (Ort: T9, 005, 14:00 Uhr) |
Tutorials
Wir treffen uns in der Woche vom 10.04. - 13.04. um jeweils 10:00 Uhr im unten angegebenen Raum.
Bitte bringt euren
Laptop mit!
Die wichtigsten Folien findet ihr unten zum Download.
- Dienstag 10.04.2012: Arnimalle 14, 1.1.53 Seminarraum E2
- Mittwoch 11.04.2012: Arnimalle 14, 1.1.53 Seminarraum E2
- Donnerstag 12.04.2012: tbd
- Freitag 13.04.2012: Arnimalle 14, 1.1.26 Seminarraum E1
Referenzen
Achtung: Die Paper-Links gehen nur von der FU (bzw. VPN) aus.
- Sturm M, Bertsch A, Gröpl C, et al. OpenMS - an open-source software framework for mass spectrometry. BMC Bioinf. 2008;9:163. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18366760.
- Kohlbacher O, Reinert K, Gröpl C, et al. TOPP--the OpenMS proteomics pipeline. Bioinformatics (Oxford, England). 2007;23(2):e191-7. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17237091.
- Lange E, Gröpl C, Schulz-Trieglaff O, et al. A geometric approach for the alignment of liquid chromatography-mass spectrometry data. Bioinformatics (Oxford, England). 2007;23(13):i273-81. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17646306
Vorlagen für Abschlussbericht und Präsentationen
Der Abschlussbericht soll detailiert auf mindestens 2 Seiten darstellen welches
Problem bearbeitet wurde, wie es gelöst wurde, welche Schwierigkeiten
aufgetreten sind und welche Ergebnisse erreicht wurden. Falls Teile der Aufgabe nicht gelöst wurden,
beschreiben Sie die Gründe dafür. Sehen Sie noch Potential für die Verbesserung des Algorithmus?
Links
- Homepage von OpenMS: Hier gibt es alle Informationen sowie aktuelle Snapshots der Bibliothek zum herunterladen.
- OpenMS Dokumentation: Die Doku des letzten OpenMS-Releases.
- OpenMS Trac: System für Fehlerreports in OpenMS und direkter Einblick in den aktuellen Entwicklungsstand des Projekts. Hier könnt ihr Fehler melden, wenn ihr welche gefunden habt.