ThesisMCRazerWorkPlan

• Implementieren des Open hashing Q-gram index
• Paralleles filtern der Referenz in über kürzere Abschnitte dann parallel verifizieren (parallel meint mehrere kleinere Indices, die jeweils nur einen Teil der reads umfasst)
• Oder ein filter und mehrere Verifizierer
  • reicht der Token-Ansatz, damit Cache-Lokalität gewährleistet ist?
  • oder muss das über die Distanz geregelt werden?

• Parallelisiertes Sort für die Ausgabe nutzen
• Parallelisieren des Realignments, wenn Option gesetzt