Thema der Dissertation:
Contributions to the detection of non-reference sequences in population-scale NGS data Thema der Disputation:
Population-scale genotyping of genomic variants using GraphTyper
Contributions to the detection of non-reference sequences in population-scale NGS data Thema der Disputation:
Population-scale genotyping of genomic variants using GraphTyper
Abstract: Der Genotyp (engl. genotype) beschreibt die Ausprägung von genomischen Varianten im Erbgut eines Individuum. GraphTyper ist eine Software, die mittels eines Pan-Genom Graphen und NGS Daten den wahrscheinlichsten Genotyp pro genomischer Variante eines Individuums bestimmt. Hierzu werden Sequenzierdaten mit der Graphstruktur verglichen und Wahrscheinlichkeiten für jeden möglichen Genotyp ermittelt. Anwendungen von GraphTyper verdeutlichen, dass GraphTyper simpleren Modellen zur Bestimmung des Genotyp überlegen ist und auch für große Datensätze anwendbar ist.
Zeit & Ort
29.04.2022 | 10:00
Hörsaal B (0.1.01)
(FB Physik, Arnimallee 14, 14195 Berlin)