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ChipSeq
ChIP Seq Motivanalyse Konzept Bei der ChIP Seq Analyse werden die genomweiten Bindungsstellen von Transkriptionsfaktoren dadurch identifiziert, dass man die Tran...
JMatch
In diesem Praktikum geht es um die Erstellung von Software, um die Bindungsstellen von Transkriptionsfaktoren in DNA Sequenzen zu identifizieren und die Auswirkun...
r2 - 13 Apr 2012 - 16:10 by BirteKehr
LectureWiki
OUT OF USE! Go to: https://kvv.imp.fu berlin.de/portal/ * SS 2018 * PMSB SeqAn * SS 2017 * PMSB SeqAn * SS 2016 * Journal Club * ...
NormEditDist
PISB SeqAn Projekt Normalised Edit Distance Hintergrund: Normalisierte Edit Distanz Die Edit Distanz ist ein Standarddistanzmaß für Sequenzalignments, Mappings...
RepeatMasking
Repeat Masking Repeats in DNA Sequenzen sind ein häufig beobachtetes Phänomen. Insbesondere in den ersten Schritten der Genome Analyse verursachen sie Probleme, d...
r5 - 13 Apr 2012 - 15:11 by JochenSinger
RnaSeqMSplazers
PISB SeqAn Projekt RNA Seq: Mapping von RNA reads mit MSplazer Hintergrund: Mapping von RNA reads Im Gegensatz zum Whole Genome Sequencing, wo ein kompletter...
RnaSeqReadSimulator
PISB SeqAn RNA Seq Read Simulator Hintergrund: RNA Seq Simulation Simulierte Daten leisten wichtige Dienste bei der Entwicklung, Fehlersuche und Bewertung von ...
SegementAligner
PISB SeqAn Teilprojekte Segment Aligner Hintergrund: Hierarchisches Genomalignment Um das Alignment ganzer Genome zu ermöglichen, werden in der Regel zunächst ...
r3 - 13 Mar 2012 - 14:31 by BirteKehr
SimpleBowtie
Simple Bowtie Bowtie ist ein "ultrafast and memory efficient" Read Mapper 1 der auf der Burrows Wheeler Transformation (BWT) basiert. Die BWT eines Textes T ist...
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