Multi Split Mapping of NGS reads for variant detection Student Sabrina Krakau Academic Advisor Prof. Dr. Knut Reinert, Anne Katrin Emde Expose The goal ...
Multi Split Mapping of NGS reads for variant detection Student Kathrin Trappe Academic Advisor Prof. Dr. Knut Reinert, Anne Katrin Emde Expose The goal ...
PSMB_Seqan_2014_SNP_caller Hintergrund Die häufigste und kleinste mögliche genomische Variation ist der Single Nucleotide Polymorphism. Nach dem Mapping von Read...
PSMB_Seqan_2014_large_insertd Hintergrund Lange Sequenzstücke, die im Donor aber nicht in der Referenz enthalten sind, lassen sich nur schwer mit einzelnen Reads...
PSMB_Seqan_2014_mapper Hintergrund Der erste Schritt ein einer Pipeline zur Analyse von Genomvarianten ist das Read Mapping. Dabei soll für jeden NGS Read eigent...
PSMB_Seqan_2014_small_indels Hintergrund Neben SNPs sind kleine Insertionen und Deletionen (indels) eine Klasse wichtiger genomischer Varianten. Für die Suche so...
PSMB_Seqan_2016_p3 Hintergrund Der erste Schritt ein einer Pipeline zur Analyse von Genomvarianten ist das Read Mapping. Dabei soll für jeden NGS Read eigentlich...
Implementation and Evaluation of a Myrimatch Adapter Student Dimitri Schachmann Academic Advisor Prof. Dr. Knut Reinert, Chris Bielow Expose The goal of...
Page ThesisGenomesPerMail ((short description what this page is about)) Expose Rene, please write an expose for the thesis here with the following tasks. Task...
Overlap Module for NGS Pipeline Summary The overlap module merges the information retained by read mapping to a genome with annotation information (for example g...
Complemented palindromes Zusammenfassung Implementierung und Vergleich drei verschiedener Ansätze zum Finden von maximalen, komplementären Palindromen einer sign...
Parallelism In The SeqAn Library The purpose of this thesis is to allow "easy parallelism" in the SeqAn library. This will consist of identifying parts of the lib...